mongodb,R对MongoDB的性能测试——RMongo

在九月初的时候,RMongoDB正式发布了修订版本,这也就意味着,从事数值计算的语言也可以于Nosql产品相接轨了,但是鉴于我身边并没有公司真的在使用R和MongoDB的结合,所以在效率问题上,我们也不敢掉以轻心,所以就做了一个这样的测试。
测试环境是8核,64位机。 用于测试的库是一个未经Sharding,大概30G左右的Collection。用于存储用户的喜好信息,标签信息等数据。
1 library(rmongodb) 2 3 mongo <- mongo.create() 4 5 if(mongo.is.connected(mongo)) 6 { 7 ns <- 'rivendell.user' 8 print('查询一个没有索引的字段,查询一条') 9 print(system.time(p <- mongo.find.one(mongo,ns,list(Friend=600)))) 10 print('查询一个没有索引的字段,多条,without buffer') 11 print(system.time(p <- mongo.find(mongo,ns,list(Friend=600)))) 12 print('看看是否有缓存策略') 13 print(system.time(p <- mongo.find(mongo,ns,list(Friend=600)))) 14 15 print('查询一个没有索引的字段,多条,has buffer') 16 buf <- mongo.bson.buffer.create() 17 mongo.bson.buffer.append(buf,'Friend',600L) 18 query <- mongo.bson.from.buffer(buf) 19 print(system.time(p <- mongo.find(mongo,ns,query))) 20 print('看看是否有缓存策略') 21 buf <- mongo.bson.buffer.create() 22 mongo.bson.buffer.append(buf,'Friend',600L) 23 query <- mongo.bson.from.buffer(buf) 24 print(system.time(p <- mongo.find(mongo,ns,query))) 25 26 print('大于的查询,查询一条记录') 27 print(system.time(p <- mongo.find.one(mongo,ns,list(Friend=list('$gt'=600L))))) 28 print('大于的记录,查询多条记录') 29 print(system.time(cursor <- mongo.find(mongo,ns,list(Friend=list('$gt'=600L))))) 30 mongo.cursor.destroy(cursor) 31 32 print('查询一条有索引的记录') 33 print(system.time(p <- mongo.find.one(mongo,ns,list('_id'=3831809L)))) 34 print('查询索引的记录') 35 print(system.time(p <- mongo.find(mongo,ns,list('_id'=3831809L)))) 36 37 print('插入一条记录') 38 buf <- mongo.bson.buffer.create() 39 mongo.bson.buffer.append(buf,'name',"huangxin") 40 mongo.bson.buffer.append(buf,'age',22L) 41 p <- mongo.bson.from.buffer(buf) 42 print(system.time(mongo.insert(mongo,ns,p))) 43 44 print('找到刚刚插入的记录') 45 print(system.time(p <- mongo.find.one(mongo,ns,list('name'='huangxin')))) 46 if(!is.null(p)) 47 { 48 print('success') 49 } 50 51 print('批量插入') 52 53 buf <- mongo.bson.buffer.create() 54 mongo.bson.buffer.append(buf,'name','huangxin') 55 mongo.bson.buffer.append(buf,'age',22L) 56 p1 <- mongo.bson.from.buffer(buf) 57 58 buf <- mongo.bson.buffer.create() 59 mongo.bson.buffer.append(buf,'name','huangxin') 60 mongo.bson.buffer.append(buf,'age',22L) 61 p2 <- mongo.bson.from.buffer(buf) 62 63 buf <- mongo.bson.buffer.create() 64 mongo.bson.buffer.append(buf,'name','huangxin') 65 mongo.bson.buffer.append(buf,'age',22L) 66 p3 <- mongo.bson.from.buffer(buf) 67 68 print(system.time(mongo.insert.batch(mongo,ns,list(p1,p2,p3)))) 69 70 print('找到刚刚批量插入的记录') 71 print(system.time(cursor <- mongo.find(mongo,ns,list('name'='huangxin')))) 72 73 i <- 0 74 while(mongo.cursor.next(cursor)) 75 { 76 i <- i + 1 77 } 78 print(i) 79 80 print('批量更新') 81 print(system.time(mongo.update(mongo,ns,list(name='huangxin'),list('name'= 'kym')))) 82 83 print('查看更新是否成功') 84 print(system.time(p <- mongo.find.one(mongo,ns,list('name'='kym')))) 85 if(!is.null(p)) 86 { 87 print('success') 88 } 89 90 print('批量删除') 91 print(system.time(mongo.remove(mongo,ns,list(name='kym')))) 92 } 93 94 print(system.time(p <- mongo.find.one(mongo,ns,list('name'='kym')))) 95 if(!is.null(p)) 96 { 97 print('success') 98 }


[1] "查询一个没有索引的字段,查询一条" user system elapsed 0.000 0.000 0.115 [1] "查询一个没有索引的字段,多条,without buffer" user system elapsed 0.000 0.000 32.513 [1] "看看是否有缓存策略" user system elapsed 0.000 0.000 32.528 [1] "查询一个没有索引的字段,多条,has buffer" user system elapsed 0.000 0.000 32.685 [1] "看看是否有缓存策略" user system elapsed 0.000 0.000 33.172 [1] "大于的查询,查询一条记录" user system elapsed 0.000 0.000 0.001 [1] "大于的记录,查询多条记录" user system elapsed 0.000 0.000 0.014 [1] "查询一条有索引的记录" user system elapsed 0 0 0 [1] "查询索引的记录" user system elapsed 0 0 0 [1] "插入一条记录" user system elapsed 0 0 0 [1] "找到刚刚插入的记录" user system elapsed 0.00 0.00 35.42 [1] "success" [1] "批量插入" user system elapsed 0 0 0 [1] "找到刚刚批量插入的记录" user system elapsed 0.004 0.000 35.934 [1] 7 [1] "批量更新" user system elapsed 0.000 0.004 0.000 [1] "查看更新是否成功" user system elapsed 0.000 0.000 67.773 [1] "success" [1] "批量删除" user system elapsed 0 0 0 user system elapsed 0.000 0.000 91.396


之前我一直不太理解的就是为什么大于和等于,差距会差这么多。后来当我在用Python去做同样的测试的时候发现,Python两者的效率其实是相同的,所以这就证明了这个不是MongoDB的问题,而我不相信在数据库层面,一个语言的Driver会有这么大的差别。
后来我发现了Python和R的关于MongoDB Driver的一个区别。首先,Python find的时候,不是将查询到的数据集整体拉回,而是返回一个cursor,也就是说,他在执行find命令的时候并不消耗时间,而如果加上while cursor.next()的时候,才会真正地去执行这个查询。
但是R不一样,R会首先考虑数据集的大小(或者其他情况),然后视情况而定地返回cursor还是将整个数据集整体拉回。如果我们将之前的while mongo.cursor.next(cursor)也算在计算时间的时候,那么我们就会发现,其实大于和等于的操作,效率相差并不明显了.......
在实际操作中,批量插入是一个非常常见的应用场景,但是对于R或者Matlab语言来说,循环的效率一直是硬伤,所以接下来,我会尝试着用apply系列来解决R语言的循环问题,如果实际操作发现可行,那么接下来使用mutilab等R的并行计算库来充分发挥多核的效率也值得尝试了!
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