作为系统的使用者，我无法从技术层面去分析两种方向的孰优孰劣，不过碰巧的是两种模式的系统我都经历过，算是从用户角度上有一定的发言权，下面就谈谈我的感受。
对于系统，我们作为最终用户，心态永远是希望在满足业务处理要求基础上能最大程度上的简化操作（至少我是这样：），其次是响应速度够快，当然还有系统界面的友好程度和管理的难度。
从这几个要求来看，我认为综合系统和专业系统都能较好的满足业务功能上的需要，而差异则主要在以下几个方面：
一、简化操作方面：
通常大家都认为综合系统把查询、统计等等管理功能都集成在一个系统中，对于用户来说应该是简化了操作。其实不然！因为用户真正需要查询、统计数据时，往往涉及不止一个业务系统，如果查询功能都单独附属在单一的业务系统中，将意味着必须在不同业务系统中分别查询数据并进行人工合并！这可是个苦差事！
专业的查询平台或系统，将查询功能独立业务系统之外，实现对不同业务系统数据的跨系统查询，这就比较好的解决了综合系统存在的上述问题。
综上说述，综合系统在平时小范围业务查询上占优，而专业系统在综合业务查询及统计上则有明显优势，本项目两者平手。
二、响应速度
作为用户，最怕的是人等系统，性急火燎却要耐心等系统查询、等统计、等报表，这在平时还能忍受，一旦逢季末、年底等数据考核业绩发钱的时候，就要命了！
综合系统由于既是业务系统，又是管理信息系统，所以在执行查询时的效率非常容易受到整个系统业务处理情况的影响，平时几秒钟解决的查询问题可能在业务高峰时期半个小时也搞不定，说不定一个死循环还能把整个业务系统拉垮。一个系统如此，几个系统查下来没有充足的时间是搞不定的。
专业的查询系统在这方面优势比较明显！独立于业务系统，速度上有保证，遇到问题也是查询系统自己的问题，不至于影响正常业务，再加上是综合查询，一个系统搞定所有数据，效率上是综合系统无法比拟的。
这个环节专业系统胜出。
三、界面的友好程度和管理难度
这点上也是各有优势。
综合系统胜在一类业务一气呵成，连贯性好，业务人员操作起来比较应手；而专业系统长处则反映在“专”上，需要一定时间的适应，如日常不用仅季末、年初才接触，会存在反复熟悉的过程。
这点上各有高下，也是平分秋色。
通过此比较，站在用户角度上，个人认为业务系统还是偏重业务处理较好，最多加一些简单的业务查询功能即可，大量的专业查询、统计、管理工作最好交由专业的查询、统计、分析平台去做。当然，前提是这些专业的平台必须能满足我的查询、统计、管理要求！
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